解讀羊水穿刺基因檢測報告,科學認知染色體拷貝數變異(CNV)
遺傳學檢查通常分為分染色體水平和基因水平的檢測。再次強調臨床上絨毛取樣,羊水或臍血穿刺實際上都是指獲取胎兒樣本的手段而非檢測方法。獲取胎兒樣本后根據不同的臨床指征會選擇相應的檢測手段,如染色體培養核型分析,染色體拷貝數檢測,基因檢測等。
目前臨床上染色體層面最常用的檢測方法就是核型分析和染色體拷貝數(CNV)檢測。
本系列分為三個小文章,分別從染色體核型、染色體拷貝數變異及基因突變方面跟大家聊聊如何合理的解讀羊水穿刺后的檢測結果,避免孕婦及家屬增加不必要的擔憂,但又不耽誤常規診療。
染色體CNV檢測亦可稱為“染色體微小缺失微小重復檢測”,舉個例子:“核型檢查”可理解為我們在遠處看一個大樓,只能看到這個大樓的外觀及高矮胖瘦,而CNV檢測就相當于我們用“華為P30 pro”來看這個大樓,這樣就能看到每個樓層的情況,如果還不理解的話見下圖,當然第四張圖純是為了表示效果并不代表真實情況。
“核型檢測” 與 “CNV檢測”
“核型檢測”與“CNV檢測模式圖”
目前染色體CNV或者說微缺失微重復檢測方法通常有兩種:一個通俗叫做“芯片”,一個通俗叫“測序”。實際上準確的叫法一個是【染色體微陣列分析(chromosome microarray analysis, CMA),檢測基于芯片平臺】;一個是【低深度全基因組測序(copy number variation sequencing, CNV-seq),檢測基于高通量測序平臺】。這兩種方法的專家指南都已經發表,但需要特別特別強調的是這兩個技術都是檢測染色體層面的,跟基因沒什么關系,千萬不要以為做這兩個檢測就能把單基因病檢測出來。另外,大家不用特別糾結這兩種檢測方法的區別,對于臨床診斷來說都足夠。
再來說說染色體CNV檢測的結果,大致可以分三類:【完全正常或多態性】,【致病性片段】及【臨床意義未明】。值得一提的是,由于分子遺傳學檢測技術的發展,比如染色體CNV檢測,染色體層面的產前診斷的時間不再局限于細胞培養的最佳時間(18-26周),臍血穿刺也幾乎被羊水取代。下面我以幾個盛京醫院羊水報告來舉例,大概講講如何解讀這三個結果。
盛京醫院報告樣式
1.完全正常或多態
完全正常或多態:通常看見這兩種即代表并未檢出異常,可以認為染色體是正常的。只要產檢時拿給醫生看下即可。
下面是兩份結果為含有致病片段的報告:
2.致病性片段
致病性片段:通常導致胎兒畸形或出生缺陷。如果報告上描述的畸形與胎兒超聲有相符合的癥狀,那就更加提高胎兒患病的風險,這時應立即找專業的產前診斷醫生進行下一步處置。
3.臨床意義未明片段
這種情況是臨床上最常見的,出現這樣的結果通常應為這樣的片段數據庫沒有記載,同時文獻中也無法查到其是否致病。由于技術的發展,我們每天都會檢測出來很多新的未知的變異,這些變異是否致病目前尚不清楚,缺乏大的數據的統計,但隨著數據積累的越來越多,我們對這些變異的功能都會搞清楚(這也是我工作的一個內容)。對于這樣的片段的理解通常如下:
(1)如果缺失片段在1Mb以下,重復片段在1.5Mb以下,而且不包含基因,一般來說應該只是個正常變異,絕大部分都是遺傳自正常雙親,所以當看到報告里寫著有0._Mb缺失重復的時候,千萬別上火動了胎氣,尤其是超聲未提示任何異常,這時請按照正常產檢的心情來咨詢并進行下一步診治;
(2)當缺失重復片段較大,且不包含任何基因,也無任何超聲異常時,請不要著急上火,速來找專業醫生咨詢,我們見過正常人缺失7MB情況,沒有任何異常,胎兒也攜了這個缺失片段,生后亦無異常;
(3)無論缺失重復片段大小與否,如果包含相關基因,也請不要著急,速來找專業醫生咨詢并驗證該判斷來源,如果該片段是從雙親遺傳下來的,通常也不會致病。
(4)對于臨床意義未明片段通常診斷最準確的方法就是驗證父母并結合超聲!
下面是一份結果為含有臨床意義不明的報告:
以上內容只是臨床上比較常見的簡單的情況的解讀和處理,主要還是為了降低孕婦及家屬的心理壓力做的科普。
醫學發展到今天也并未完全對神秘的人體研究透徹,真相有時令人大跌眼鏡。因此,千萬不能根據以上內容自己決定胎兒的去留,這是需要專業的醫生來判斷的。最后,無論任何情況下,如有不懂和疑問,請一定到正規的產前診斷中心找專業的醫生進行遺傳咨詢。